< Terug naar vorige pagina

Project

Bacteriofagen in het verteringsstelsel van de honingbij en hun effect of gezondheid en ontwikkeling

Ondanks de recente vooruitgang in de kennis van het metagenoom van de honingbij, zijn er zeer weinig gegevens beschikbaar over het prokaryote virale deel (bacteriofagen) van het microbioom bij honingbijen. Bacteriofagen worden wereldwijd beschouwd als de meest voorkomende biologische organismen. Ze vervullen een essentiële rol binnen hun respectieve ecosystemen en hebben een sterke invloed op hun gastheren en ecosysteemevenwichten. De veelheid aan functies die prokaryote virussen kunnen uitoefenen binnen hun biosfeer, gecombineerd met het feit dat de honingbij-bacteriota een cruciale rol spelen in de bijengezondheid, impliceert dat de virale microbiota ook hier een belangrijke rol zou kunnen spelen. Het hoofddoel van dit project is om een gedetaileerde in silico en in vivo karakterisering uit te voeren van de bacteriofaagpopulatie die de belangrijkste leden van de honingbijendarmmicrobiota infecteert, en om hun rol in de gezondheid en ontwikkeling van honingbijen te bestuderen. Hiervoor hebben we toegang tot stalen verzameld tijdens het Europese B-GOOD-project. Zowel het bacterioom (16S) als het viroom (shotgun) in het spijsverteringskanaal van honingbijen zullen worden gekarakteriseerd. Bacteriën zullen worden geïsoleerd en gekarakteriseerd uit de middendarm, ileum en endeldarm. Deze bacteriële isolaten zullen worden gebruikt om bacteriofagen te isoleren, gevolgd door hun genoomsequentiebepaling en functionele gen-annotatie. Ten slotte zullen microbiota-vrije werkbijen worden geïnoculeerd met verschillende combinaties van bacteriën en hun bacteriofagen in in vivo experimenten om hun effecten op de gezondheid, het gedrag en de ontwikkeling van honingbijen te onderzoeken.

Datum:2 apr 2021 →  Heden
Trefwoorden:Metagenomics, Viral metagenomics, Bacteriophages, Phages, Honey bee, Apis mellifera, Virology, Bioinformatics, Sequencing
Disciplines:Metagenomica
Project type:PhD project