Het menselijke viroom in ademhalings- en huidstoornissen

Het menselijke viroom, de verzameling eukaryote en prokaryote virussen die in en op ons lichaam leven, is een integraal maar ondergewaardeerd onderdeel van het microbioom. Virussen interageren met het immuunsysteem en andere leden van het microbioom en bepalen mee de ziekte en gezondheid van de mens. Er blijven echter technische uitdagingen voor het uitvoeren van uitgebreide viroomanalyse op klinische stalen met een lage biomassa. De doelstellingen van dit project is de ontwikkeling van gevoelige virome detectie- en analysepijplijnen, waarbij minimale bias wordt geïntroduceerd, voor huid- en sputummonsters, twee uitdagende monstertypes met een lage biomassa. Deze virome-analysepijplijnen zullen voortbouwen op de bestaande NetoVIR-protocol dat ontwikkeld werd in het Laboratorium voor Virale Metagenoom analyse. Dit protocol combineert de zuivering van virale partikels, Illumina-sequencing en bio-informatica-analyse. Deze pijplijn zal gebruikt worden om de viroomcomponent te bestuderen in stalen uit klinische studies. Integratie van de viroomcomponent in grote epidemiologische studies zullen helpen om ons begrip van de etiologie van ziekten voor specifieke huid- en ademhalingsstoornissen te vergroten. Een meer holistische visie op het menselijk microbioom, inclusief een gedetailleerde analyse van de viroomcomponent ervan, zal ons helpen vaccindoelstellingen te ondersteunen, nieuwe biomerkers te ontdekken en verder te ontwikkelen voor gepersonaliseerde vaccinstrategieën.