Next-generation bioprocess engineering: faag-gebaseerde synthetische herprogrammering van bacteriële bioreactor populaties

Door een combinatie van synthetische biologie met modellering van zowel genregulatie als populatie dynamica, beoogt dit project de ontwikkeling van een innovatieve manier voor de genetische herprogrammering van bacteriële populaties. Meer bepaald zal het onderzoek zich toeleggen (i) op faag-gemedieerde transductie als hoogst efficiënte manier voor de verspreiding van genetische instructies doorheen een bacteriële populatie, (ii) op het ontwerpen van synthetische circuits die gefaseerde genetische instructies opleggen aan de cellen (ter bevordering van groei, productie en oogst), en (iii) op de constructie van een populatiebalansmodel uitgerust met genetische circuits en metabolische netwerk informatie dat de afstemming voor faag, circuit en bioreactorprocescondities voor optimale productie berekent. Het vernieuwende transmissieinstrument, de geschakelde genetische circuits en de modelleringsbenadering bieden een innovatief platform voor dynamische expressie van gewenste eiwitten (nanobodies) in bioreactorpopulaties, en zullen de basis leggen voor bredere toepassingen in het bereiken en dirigeren van bacteriële populaties in hun natuurlijke en vaak moeilijk toegankelijke omgeving.