Valideren van nieuwe AI-voorspelde targets voor alternatieve immunotherapie in kanker

Anti-kanker immunotherapie heeft een enorm potentieel maar wordt belaagd door resistentie en gebrek aan efficiëntie die deels te wijten zijn aan de immuunsuppressieve (ImmuSup) aard van de endotheelcellen (EC) in de tumor bloedvaten. Mijn doel is om die ECs van ImmuSup naar immuunstimulerend om te vormen als een alternative vorm van IT (alterIT). Daarbij besef ik dat (te) veel resultaten uit het basisonderzoek stranden in de spreekwoordelijke ‘Valley of Death’ en zich niet vertalen in medicijnen/klinische behandelingen omwille van problemen met selectiviteit en toxiciteit als gevolg van suboptimale initiële target selectie en validatie. Daarom zal ik 1) de in-huis ontwikkelde artificiële intelligentie tool scMysterYdentifier gebruiken om echt nieuwe ImmuSup genen te identificeren in het ‘mysterie-genoom’ (1/3 van het genoom dat niet/onvoldoende functioneel geannoteerd is), een echte ‘goudmijn’ om innovatieve targets in te ontdekken; 2) de voorspelde ImmuSup mysterie-genen onmiddellijk in vivo valideren met de in-huis ontwikkelde REVOLT transgene technologie die toelaat om snel (in dagen) en goedkoper EC-selectieve knock-out muizen te genereren; 3) uitgebreide in silico expressie analyses uitvoeren om een (eerste) zicht te hebben op selectiviteit/toxiciteit van het target. Alle technieken zijn operationeel. Perspectieven: ter dege in vivo gevalideerde innovatieve en selectieve EC ImmuSup mysterie-targets voor AlterIT met hoog potentieel om de ‘Valley of Death’ te overbruggen.