Beeldverwerkingsplatform voor gebruikers van de GLiM core facility

De Ghent Light Microscopy (GLiM) Core Facility biedt toegang tot geavanceerde lichtmicroscopietechnieken voor onderzoekers van de UGent en daarbuiten. Lichtmicroscopie speelt een onmisbare rol in het levenswetenschappen onderzoek en biedt inzicht in hoe levende cellen en organismen functioneren onder relevante omstandigheden. Naast staalvoorbereiding en beeldopname is het analyseren van de verkregen beelden om kwantitatieve informatie te extraheren een essentieel onderdeel van de wetenschappelijke workflow. Op dit moment zijn GLiM-gebruikers afhankelijk van freeware-oplossingen met beperkte mogelijkheden en een lage gebruiksvriendelijkheid. Om gebruikers te ondersteunen in de volledige microscopie workflow, vraagt ​​GLiM om een ​​geavanceerd beeldverwerkingsplatform via deze projectaanvraag. Door een robuuste softwareoplossing te integreren in de GLiM Core Facility, streven we naar toegankelijke, workflow gestuurde beeldanalyse die efficiënte dataverwerking mogelijk maakt. De voorgestelde infrastructuur biedt uitgebreide opties voor beeldanalyse, waaronder preprocessing, segmentatie, kwantificering, AI-integratie en batchverwerking. De software zal worden geïmplementeerd binnen de GLiM Core Facility, waardoor brede toegankelijkheid wordt gegarandeerd voor zowel onderzoekers van de Universiteit Gent als externe gebruikers. Daarnaast zal de infrastructuur ook educatieve activiteiten ondersteunen, zoals de specialisatie cursus “Advanced Light and Fluorescence microscopy” die GLiM jaarlijks organiseert voor de doctoraatsopleiding. Door een geavanceerd, intuïtief beeldanalyseplatform beschikbaar te stellen via GLiM, faciliteren we hoogwaardig, reproduceerbaar wetenschappelijk onderzoek en elimineren we technische barrières in het microscopie gebaseerde onderzoek.