Onderzoeker
Kathleen Marchal
- Trefwoorden:bio-informatica
- Disciplines:Andere biologische wetenschappen niet elders geclassificeerd, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Andere natuurwetenschappen niet elders geclassificeerd, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica van ziekten, Algemene biologie niet elders geclassificeerd, Biologie en andere natuurwetenschappen, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Bioinformatica, Medische genomics
Affiliaties
- Vakgroep Informatietechnologie (Departement)
Lid
Vanaf1 mrt 2018 → Heden - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 sep 2011 → Heden
Projecten
1 - 9 of 9 results
- Een datagedreven integratiestrategie voor de identificatie van essentiële biologische processen en hun werkingsmechanisme in kanker.Vanaf1 nov 2019 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- De integratie van cohort-afgeleide moleculaire en klinische informatie ter verbetering van precisie oncologieVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - Nieuwe Onderzoeksinitiatieven
- Integratie van systeemgenetische data in kanker voor de identificatie van causale mutaties en hun modus operandiVanaf1 okt 2018 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Het belang van epistase en netwerk-rewiring in het bepalen van het adaptief gedrag van bacterien onderworpen aan antibiotica-gradientenVanaf1 jan 2018 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject
- Meer snelle en accurate identificatie van ( zoönotische ) Salmonella serotypes onderworpen aan een officiële controle bij pluimvee en varkensVanaf1 feb 2015 → 31 aug 2018Financiering: Ministerie van Sociale Zaken, Volksgezondheid en Leefmilieu
- Genetische aanpassing van bacteriële katabole afbraakwegen voor pesticide biodegradatie: rol van historische contingentie.Vanaf1 jan 2015 → 31 dec 2020Financiering: FWO Onderzoeksproject
- Netwerk-gebaseerde identificatie van het moleculaire werkingsmechanisme van anti-bacterial agentiaVanaf1 jan 2013 → 31 dec 2016Financiering: SBO (Strategisch Basisonderzoek)
- Netwerk-gebaseerde analyse van genotype-expressie fenotype dataVanaf1 jan 2013 → 31 dec 2018Financiering: FWO Onderzoeksproject
- Bioinformatica : van nucleotiden tot netwerken ( N2N )Vanaf1 mei 2010 → 30 apr 2017Financiering: BOF - Andere acties
Publicaties
1 - 10 of 142 results
- Low immunogenicity of common cancer hot spot mutations resulting in false immunogenic selection signals(2021)
Auteurs: Arne Claeys, Tom Luijts, Kathleen Marchal, Jimmy Van den Eynden
Aantal pagina's: 1 - First detection of a plasmid-encoded New-Delhi metallo-beta-lactamase-1 (NDM-1) producing Acinetobacter baumannii using whole genome sequencing, isolated in a clinical setting in Benin(2021)
Auteurs: Carine Yehouenou, Bert Bogaerts, Kevin Vanneste, Nancy H. C. Roosens, Sigrid C. J. De Keersmaecker, Kathleen Marchal, Dissou Affolabi, Reza Soleimani, Hector Rodriguez-Villalobos, Francoise Van Bambeke, et al.
Aantal pagina's: 1 - A practical method to implement strain-level metagenomics-based foodborne outbreak investigation and source tracking in routine(2020)
Auteurs: Florence Buytaers, Assia Saltykova, Sarah Denayer, Bavo Verhaegen, Kevin Vanneste, Nancy H. C. Roosens, Denis Piérard, Kathleen Marchal, Sigrid C. J. De Keersmaecker
Aantal pagina's: 1 - Development of an NGS-based workflow for improved monitoring of circulating plasmids in support of risk assessment of antimicrobial resistance gene dissemination(2020)
Auteurs: Bas Berbers, Pieter-Jan Ceyssens, Pierre Bogaerts, Kevin Vanneste, Nancy Roosens, Kathleen Marchal, Sigrid C.J. De Keersmaecker
Aantal pagina's: 1 - Strain-level metagenomic data analysis of enriched in vitro and in silico spiked food samples : paving the way towards a culture-free foodborne outbreak investigation using STEC as a case study(2020)
Auteurs: Assia Saltykova, Florence Buytaers, Sarah Denayer, Bavo Verhaegen, Denis Piérard, Nancy H. C. Roosens, Kathleen Marchal, Sigrid C. J. De Keersmaecker
Aantal pagina's: 1 - The benefits of whole genome sequencing for foodborne outbreak investigation from the perspective of a national reference laboratory in a smaller country(2020)
Auteurs: Stéphanie Nouws, Bert Bogaerts, Bavo Verhaegen, Sarah Denayer, Florence Crombé, Klara De Rauw, Denis Piérard, Kathleen Marchal, Kevin Vanneste, Nancy H. C. Roosens, et al.
Aantal pagina's: 1 - Culture-independent analysis of linuron-mineralizing microbiota and functions in on-farm biopurification systems via DNA-stable isotope probing : comparison with enrichment culture(2020)
Auteurs: Harry Lerner, Basak Öztürk, Anja B. Dohrmann, Joice Thomas, Kathleen Marchal, René De Mot, Wim Dehaen, Christoph C. Tebbe, Dirk Springael
Pagina's: 9387 - 9397 - Cancer LncRNA Census reveals evidence for deep functional conservation of long noncoding RNAs in tumorigenesis(2020)
Auteurs: David Mas-Ponte, Rory Johnson, Federico Abascal, Samirkumar B. Amin, Gary D. Bader, Jonathan Barenboim, Rameen Beroukhim, Johanna Bertl, Keith A. Boroevich, Soren Brunak, et al.
Aantal pagina's: 1 - Distinct expression and methylation patterns for genes with different fates following a single whole-genome duplication in flowering plants(2020)
Auteurs: Tao Shi, Razgar Seyed Rahmani, Paul F. Gugger, Muhua Wang, Hui Li, Yue Zhang, Zhizhong Li, Qingfeng Wang, Yves Van de Peer, Kathleen Marchal, et al.
Pagina's: 2394 - 2413 - Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics data(2020)
Auteurs: Marta Paczkowska, Jonathan Barenboim, Nardnisa Sintupisut, Natalie S Fox, Helen Zhu, Diala Abd-Rabbo, Miles W Mee, Paul C Boutros, Jüri Reimand, the PCAWG Drivers and Functional Interpretation Working Group, et al.
Aantal pagina's: 1