Projecten

Het huidige doctoraatsproject kadert binnen de context van een KU Leuven interdisciplinair netwerk (IDN) project, gericht op de ontwikkeling en implementatie van een spatiaal single-cel multi-omics platform voor het bestuderen van cellulaire heterogeniteit en coöperatie in menselijke weefsels en organen bij gezondheid en ziekte. Het project zal zich richten op het ontwikkelen, implementeren en uitvoeren van complexe moleculaire ...

Het niet-coderende genoom of 'donkere materie' maakt 98% uit van het menselijk genoom. Terwijl single nucleotidevarianten (SNVs) of structurele varianten (SVs) die geassocieerd zijn met complexe oogziekten zich vooral bevinden in niet-coderende regio's, neemt het aantal voor Mendeliaanse oogziekten zoals erfelijke netvliesziekten (IRD) traag toe. Wij zullen begrip van het netvliesreguloom en in niet-coderende variatie in IRD versnellen met ...

Dit project heeft tot doel een statistisch en berekeningsraamwerk te ontwikkelen dat de integratie mogelijk maakt van informatie van de verschillende moleculaire lagen van een enkele cel (het genoom, het epigenoom en het transcriptoom). Door deze methode toe te passen op menselijke gegevens verkregen uit menselijke embryo's kunnen we vragen beantwoorden over hoe verschillende verstoringen in een bepaalde laag van invloed kunnen zijn op ...

Biologische processen zijn complex van aard en bij het analyseren ervan in het licht van slechts één soort gegevensbron wordt belangrijke complementaire informatie niet in rekening gebracht. Single-cell multi-omics, en meer recentelijk spatiale multi-omica technologieën bieden een veelzijdig beeld van cel identiteit, weefsel microarchitectuur, cellulaire communicatie en pathofysiologie. Het doel van dit project ...

Adulte glioblastomen (GBM) en pediatrische hooggradige gliomen (pHGG) zijn zeer kwaadaardige, intrinsiek resistente en onvermijdelijk terugkerende hersentumoren met een sombere prognose ondanks intensieve behandeling. Het doel van dit project is om een uitgebreide, ruimtelijke multi-omica weefselkaart te genereren door gebruik te maken van, alsook ontwikkeling van, nieuwe state-of-the-art technologieën voor geïntegreerde ruimtelijke ...

Cellen stapelen gedurende hun hele leven mutaties op. Hoewel de meeste van deze mutaties onschuldige passagiers zijn, kunnen sommige celfenotypes beïnvloeden. Zogenaamde driver-mutaties bieden een relatief fitnessvoordeel voor hun gastheercel, wat de klonale expansies ondersteunt die uiteindelijk oncogenese kunnen aanwakkeren. Hoewel sequencing van de volgende generatie en eencellige benaderingen een revolutie ...

Tumor uitzaaiing is verantwoordelijk voor 90% van alle kanker-gelinkte sterfte. Omdat de kennis van de mechanismen achter tumoruitzaaiing beperkt is, is het moeilijk om goede anti-kanker therapieën te ontwikkelen en accurate prognoses te stellen. Onderzoek toonde aan dat uitzaaiing een meerstaps proces is en cellen hiervoor gebruik maken van omkeerbare, niet-genetische mechanismen om op een flexibele manier processen als migratie, invasie en ...

Onze visie is dat cfDNA-analyse een generieke biomerker zal worden voor het diagnosticeren, screenen en stratifiëren van patiënten. Het project heeft drie wetenschappelijke doelstellingen:1) de fundamentele kennis over cfDNA uitbreiden door de biologische variatie op zowel genoom- als epigenoomniveau in gezonde en zieke mensen in kaart  te brengen,2) nieuwe technologieën ontwikkelen die gebruik maken van simultane (epi)genoomwijde ...

FOXL2 is een cruciale transcriptiefactor voor de ontwikkeling en behoud van ovaria. Ondanks de kennis over FOXL2 is er weinig geweten over de transcriptionele regulatie in ovaria. De meeste inzichten hierover zijn afkomstig van niet-coderende genetische defecten die we vonden in het blepharophimosis-syndroom (BPES), een zeldzame syndromale vorm van primaire ovariële insufficiëntie (POI), en van een geit- en muismodel. Het doel is ...