Onderzoeker
Klaas Vandepoele
- Trefwoorden (Ghent University):systeembiologie, bioinformatica, Plantenbiotechnologie
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Celdood en senescentie, Invasiebiologie, Epigenomics, Auto-ecologie, Biogeografie en fylogeografie
- Disciplines (Ghent University):Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Systeembiologie niet elders geclassificeerd, Cel- en moleculaire biologie van planten, Single-cell data analyse, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie
Affiliaties
- Vandepoele Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2018 → Heden - De Veylder Lab (Onderzoeksgroep)
Lid
Vanaf1 jan 2017 → 31 dec 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 dec 2000 → Heden
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- ELIXIR België (Consortium partner)
Projecten
1 - 10 of 18
- De verborgen tuin: adaptatie en evolutie van diatomeeën in benthische habitatsVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Beoordeling van de rollen van endogene en omgevingsfactoren die de celgrootteverdeling en seksuele reproductie in benthische diatomeeënpopulaties regelenVanaf1 nov 2022 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Het in kaart brengen van functionele componenten van de diverse levenscycli in diatomeeën.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Identificatie van het gen regulerende netwerken vasculaire ontwikkeling in planten - een vergelijkende benadering op single-cell resolutieVanaf1 okt 2021 → 14 okt 2022Financiering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Enzym biodiscovery-pijplijnoptimalisatie via toolbox-ontwikkelingVanaf1 sep 2021 → HedenFinanciering: VLAIO - Catalisti - cSBO
- Software ontwikkeling voor ontdekking en prioritizering van genen belangrijk voor plant-eigenschappen op basis van single-cell moleculaire profilering.Vanaf1 jun 2021 → 31 dec 2023Financiering: IOF - technologie validatie in labo
- Reproductieve barrières, interspecifieke gene flow en diversificatie in een wereldwijd voorkomende pennate diatomeeVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Van modelsysteem tot gewas: een network-gebaseerde benadering voor het accuraat vertalen van biologische kennis in plantenVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterkenVanaf1 jan 2019 → 31 dec 2022Financiering: FWO Internationale onderzoeksinfrastructuur (IRI)
Publicaties
81 - 90 van 133
- Towards an understanding of the cytological diversity of green seaweeds (Ulvophyceae)(2015)Volume: 50
Auteurs: Andrea Del Cortona, Frédérik Leliaert, Heroen Verbruggen, Juan M Lopez-Bautista, Klaas Vandepoele, Olivier De Clerck
Pagina's: 217 - 217 - BLSSpeller : exhaustive comparative discovery of conserved cis-regulatory elements(2015)
Auteurs: Jan Van de Velde, Dries Decap, Michiel Van Bel, Piet Demeester, Bart Dhoedt, Klaas Vandepoele, Jan Fostier
Pagina's: 3758 - 3766 - An update on LNCipedia : a database for annotated human lncRNA sequences(2015)
Auteurs: Kenneth Verheggen, Klaas Vandepoele, Lennart Martens, Pieter Mestdagh
Pagina's: D174 - D180 - Dynamic changes in ANGUSTIFOLIA3 complex composition reveal a growth regulatory mechanism in the maize leaf(2015)
Auteurs: Hilde Nelissen, Dominique Eeckhout, Kirin Demuynck, Geert Persiau, Alan Walton, Michiel Van Bel, Marieke Vervoort, Jasper Candaele, Jolien De Block, Stijn Aesaert, et al.
Pagina's: 1605 - 1619 - An improved toolbox to unravel the plant cellular machinery by tandem affinity purification of Arabidopsis protein complexes(2015)
Auteurs: Jelle Van Leene, Dominique Eeckhout, Nancy De Winne, Geert Persiau, Eveline Van De Slijke, Leen Vercruysse, Maarten Dedecker, Aurine Verkest, Klaas Vandepoele, Lennart Martens, et al.
Pagina's: 169 - 187 - Evolutionary trails of plant steroid genes(2015)
Auteurs: Cécile Vriet, Karen Lemmens, Klaas Vandepoele, Christophe Reuzeau, Eugenia Russinova
Pagina's: 301 - 308 - PLAZA 3.0 : an access point for plant comparative genomics(2015)
Auteurs: Sebastian Proost, Michiel Van Bel, Dries Vaneechoutte, Yves Van de Peer, Dirk Inzé, Bernd Mueller-Roeber, Klaas Vandepoele
Pagina's: D974 - D981 - A DNA-binding-site landscape and regulatory network analysis for NAC transcription factors in Arabidopsis thaliana(2014)
Auteurs: Søren Lindemose, Michael K Jensen, Jan Van de Velde, Charlotte O'Shea, Ken Heyndrickx, Christopher T Workman, Klaas Vandepoele, Karen Skriver, Federico De Masi
Pagina's: 7681 - 7693 - ANGUSTIFOLIA3 binds to SWI/SNF chromatin remodeling complexes to regulate transcription during Arabidopsis leaf development(2014)
Auteurs: Liesbeth Vercruyssen, Aurine Verkest, Nathalie Gonzalez Sanchez, Ken Heyndrickx, Dominique Eeckhout, Soon-Ki Han, Teddy Jégu, Rafal Archacki, Jelle Van Leene, Megan Andriankaja, et al.
Pagina's: 210 - 229 - Inference of transcriptional networks in Arabidopsis through conserved noncoding sequence analysis(2014)
Auteurs: Jan Van de Velde, Ken Heyndrickx, Klaas Vandepoele
Pagina's: 2729 - 2745