Onderzoeker
Klaas Vandepoele
- Trefwoorden (Ghent University):systeembiologie, bioinformatica, Plantenbiotechnologie
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Celdood en senescentie, Invasiebiologie, Epigenomics, Auto-ecologie, Biogeografie en fylogeografie
- Disciplines (Ghent University):Ontologieën, datacuratie en text mining, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Systeembiologie niet elders geclassificeerd, Cel- en moleculaire biologie van planten, Single-cell data analyse, Analyse van next-generation sequence data, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie
Affiliaties
- Vandepoele Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2018 → Heden - De Veylder Lab (Onderzoeksgroep)
Lid
Vanaf1 jan 2017 → 31 dec 2017 - Vakgroep Plantenbiotechnologie en Bio-informatica (Departement)
Lid
Vanaf1 dec 2000 → Heden
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- ELIXIR België (Consortium partner)
Projecten
1 - 10 of 18
- De verborgen tuin: adaptatie en evolutie van diatomeeën in benthische habitatsVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Beoordeling van de rollen van endogene en omgevingsfactoren die de celgrootteverdeling en seksuele reproductie in benthische diatomeeënpopulaties regelenVanaf1 nov 2022 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Het in kaart brengen van functionele componenten van de diverse levenscycli in diatomeeën.Vanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Identificatie van het gen regulerende netwerken vasculaire ontwikkeling in planten - een vergelijkende benadering op single-cell resolutieVanaf1 okt 2021 → 14 okt 2022Financiering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Enzym biodiscovery-pijplijnoptimalisatie via toolbox-ontwikkelingVanaf1 sep 2021 → HedenFinanciering: VLAIO - Catalisti - cSBO
- Software ontwikkeling voor ontdekking en prioritizering van genen belangrijk voor plant-eigenschappen op basis van single-cell moleculaire profilering.Vanaf1 jun 2021 → 31 dec 2023Financiering: IOF - technologie validatie in labo
- Reproductieve barrières, interspecifieke gene flow en diversificatie in een wereldwijd voorkomende pennate diatomeeVanaf1 jan 2021 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Van modelsysteem tot gewas: een network-gebaseerde benadering voor het accuraat vertalen van biologische kennis in plantenVanaf1 okt 2019 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- ELIXIR Infrastructuur voor Data en Services om Life-Sciences Onderzoek in Vlaanderen te versterkenVanaf1 jan 2019 → 31 dec 2022Financiering: FWO Internationale onderzoeksinfrastructuur (IRI)
Publicaties
101 - 110 van 133
- Comparative motif discovery in the cloud(2013)
Auteurs: Jan Van de Velde, Michiel Van Bel, Piet Demeester, Bart Dhoedt, Klaas Vandepoele, Jan Fostier
Aantal pagina's: 1 - ERF115 controls root quiescent center cell division and stem cell replenishment(2013)
Auteurs: Jefri Heyman, Toon Cools, Filip Vandenbussche, Ken Heyndrickx, Jelle Van Leene, Ilse Vercauteren, Sandy Vanderauwera, Klaas Vandepoele, Geert De Jaeger, Lieven De Veylder
Pagina's: 860 - 863 - Molecular and physiological analysis of growth-limiting drought stress in Brachypodium distachyon leaves(2013)
Auteurs: Wim Verelst, Edoardo Bertolini, Stefanie De Bodt, Klaas Vandepoele, Marlies Demeulenaere, Mario Enrico Pé, Dirk Inzé
Pagina's: 311 - 322 - pico-PLAZA, a genome database of microbial photosynthetic eukaryotes(2013)
Auteurs: Klaas Vandepoele, Michiel Van Bel, Guilhem Richard, Sofie Van Landeghem, Bram Verhelst, Hervé Moreau, Yves Van de Peer, Nigel Grimsley, Gwenael Piganeau
Pagina's: 2147 - 2153 - Toward community standards in the quest for orthologs(2012)
Auteurs: Christophe Dessimoz, Toni Gabaldón, David S Roos, Erik LL Sonnhammer, Javier Herrero, the Quest Orthologs Consortium, Klaas Vandepoele, Michiel Van Bel
Pagina's: 900 - 904 - A high performance computing approach to the dicovery of conserved motifs(2012)
Auteurs: Michiel Van Bel, Piet Demeester, Bart Dhoedt, Klaas Vandepoele, Jan Fostier
Pagina's: 1 - 1 - Identification of putative cancer genes through data integration and comparative genomics between plants and humans(2012)
Auteurs: Mauricio Quimbaya Gomez, Klaas Vandepoele, Eric Raspé, Michiel Matthijs, Stijn Dhondt, Gerrit Beemster, Lieven De Veylder
Pagina's: 2041 - 2055 - Systematic identification of functional plant modules through the integration of complementary data sources(2012)
Auteurs: Ken Heyndrickx, Klaas Vandepoele
Pagina's: 884 - 901 - Gene functionalities and genome structure in Bathycoccus prasinos reflect cellular specializations at the base of the green lineage(2012)
Auteurs: Hervé Moreau, Bram Verhelst, Arnaud Couloux, Evelyne Derelle, Stephane Rombauts, Nigel Grimsley, Michiel Van Bel, Julie Poulain, Michaël Katinka, Martin F Hohmann-Marriott, et al.
- Dissecting plant genomes with the PLAZA comparative genomics platform(2012)
Auteurs: Michiel Van Bel, Sebastian Proost, Elisabeth Wischnitzki, Sara Movahedi, Christopher Scheerlinck, Yves Van de Peer, Klaas Vandepoele
Pagina's: 590 - 600