Projecten
Vasculaire functie en luchtverontreiniging: van epigenetica tot genexpressie Universiteit Hasselt
Antibioticum tolerantie in Escherichia coli: functionele karakterisatie en single-cell analyse van stochastische genexpressie van een nieuw persistentiegen. KU Leuven
Differentiële genexpressie van intestinale dendritische cellen na (in vivo) interactie met oplosbare immunuogene of tolerogene antigenen Universiteit Gent
Dendritische cellen zullen geïsoleerd worden uit de dunne darm van gespeende biggen na simulatie met oplosbare immunogene en tolerogene antigenen. De invloed van deze antigenen op de maturatie van intestinale dendritische cellen zal geanalyseerd worden door flowcytometrische analyse van co-stimulatorische moleculen en analyse van cytokine/chemokine genexpressie.
SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele cel Universiteit Gent
De nieuwe “single-cell” technologie laat toe om van elke individuele cel in een orgaan het genetisch profiel te bepalen. Op die manier werden recent nieuwe celtypes en cel activatie statussen ontdekt in bepaalde ziekten of tijdens bepaalde fasen van weefselontwikkeling. Deze technieken worden echter uitgevoerd op cel suspensies, waardoor geen ruimtelijke informatie wordt verschaft. Om de biologie te kunnen doorgronden is het echter ...
GENESIZ van PDAC: GenExpressie eN Epigenetische Signaturen In de aanZet naar Pancreatisch Ductaal Adenocarcinoom. Vrije Universiteit Brussel
dodelijke kankers. Twee moleculaire subtypes van PDAC zijn
algemeen geaccepteerd; klassieke tumoren zijn gekarakteriseerd
door expressie van typische pancreatische progenitor merkers en
basale tumoren zijn squameus/quasi-mesenchymaal van nature en
hebben een ΔNp63-signatuur.
Acinaire cellen dedifferentiëren, verkrijgen progenitor merkers en ...
MAGE – Modelleren van Allelische GenExpressie bij gezondheid en ziekte Universiteit Gent
De studie van de expressie van individuele allelen zou ons veel over de moleculaire oorzaken van ziektes zoals kanker kunnen leren, maar bestaande methodes zijn onbetaalbaar of geven maar partiële informatie. In dit project zullen we een nieuwe, goedkopere en completere methodologie ontwikkelen, gebaseerd op concepten van populatiegenetica en statistische modellering, en de meerwaarde ervan aantonen in een kankerstudie.