Onderzoeker
Katleen De Preter
- Trefwoorden (Ghent University):computationele deconvolutie, biomerker studies, genomica, vloeibare biopten, 'single' cel analyse, DNA en RNA sequenering, bioinformatica
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Analytische biochemie, Celdood en senescentie, Analyse van next-generation sequence data, Algemene diagnostiek
- Disciplines (Ghent University):Genomics, Medische metagenomics, Medische genomics, Medische epigenomics, Kankerdiagnose, Kankerbiologie, Moleculaire diagnostiek
Affiliaties
- De Preter Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf25 okt 2022 → Heden - Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2000 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 10 of 19
- Een pragmatische klinische studie van SIOPEN om neuroblastoma terugval te monitoren met vloeibare biopsieVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: HORIZON.2.1 - Gezondheid
- Universeel, kosten-effectief open-source technologieplatform voor lichaamsvloeistof-biopsie met hoge gevoeligheid, gebaseerd op het profileren van het methyloom van circulerend DNA.Vanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- NIPITplus, een multi-kanker bloed test om immuun checkpoint inhibitie respons te voorspellen en toxiciteit te monitorenVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- Opvolgen van epigenetische plasticiteit in circulerend tumor DNA met het oog op monitoren van therapie resistentie voor gepersonaliseerde behandeling in kanker patiëntenVanaf1 sep 2022 → 31 dec 2022Financiering: HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
- SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele celVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Replicatievork protectiefactoren als nieuwe doelwitten voor ombinatietherapie en immunomodulering (REINFORCE)Vanaf1 jan 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- DNA methylatie in Common Variable Immunodeficiencies (CVID): een gedetailleerde studie naar DNA methylatie heterogeniteit en relatie met ziekte klassificatieVanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Predictie van immuuntherapie response en toxiciteit in melanoom, nier- en longkanker door een transcriptoom gebaseerde immuun profilering.Vanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO mandaten
- Ontwikkeling van een minimaal-invasieve test voor accurate diagnose van CUP ("Cancer of Unknown primary") door bepaling van het DNA methylatie profielVanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Een snelle, minimaal-invasieve en betaalbare test voor accurate diagnose van 'CUP' (Cancer of Unknown Primary: metastatische kanker van onbekende oorsprong) door bepaling van het DNA methylatie profiel.Vanaf1 nov 2020 → 31 okt 2022Financiering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
Publicaties
1 - 10 van 66
- MYCN and SNRPD3 cooperate to maintain a balance of alternative splicing events that drives neuroblastoma progression(2024)
Auteurs: Alice Salib, Nisitha Jayatilleke, Janith A. Seneviratne, Chelsea Mayoh, Katleen De Preter, Franki Speleman, Belamy B. Cheung, Daniel R. Carter, Glenn M. Marshall
Pagina's: 363 - 377 - Evaluation of single-sample network inference methods for precision oncology(2024)
Auteurs: Joke Deschildre, Boris Vandemoortele, Jens Uwe Loers, Katleen De Preter, Vanessa Vermeirssen
- Human iPSC modeling recapitulates in vivo sympathoadrenal development and reveals an aberrant developmental subpopulation in familial neuroblastoma(2024)
Auteurs: Stéphane Van Haver, Yujie Fan, Sarah-Lee Bekaert, Celine Everaert, Wouter Van Loocke, Vittorio Zanzani, Joke Deschildre, Ines Fernandez Maestre, Adrianna Amaro, Vanessa Vermeirssen, et al.
- Cell-free DNA as a diagnostic and prognostic biomarker in pediatric rhabdomyosarcoma(2023)
Auteurs: Nathalie S.M. Lak, Lieke M.J. van Zogchel, Lily Zappeij-Kannegieter, Ahmad Javadi, Ruben Van Paemel, Charlotte Vandeputte, Katleen De Preter, Bram De Wilde, Mathieu Chicard, Yasmine Iddir, et al.
- Performance evaluation of RNA purification kits and blood collection tubes in the Extracellular RNA Quality Control (exRNAQC) study(2023)
Auteurs: Anneleen Decock, Olivier De Wever, Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Pieter Mestdagh, Annelien Morlion, Jo Vandesompele, Ruben Van Paemel, Francisco Avila Cobos, et al.
Aantal pagina's: 1 - Performance evaluation of RNA purification kits and blood collection tubes in the Extracellular RNA Quality Control (exRNAQC) study(2023)
Auteurs: Anneleen Decock, Olivier De Wever, Celine Everaert, Hetty Helsmoortel, An Hendrix, Pieter Mestdagh, Annelien Morlion, Jo Vandesompele, Ruben Van Paemel, Francisco Avila Cobos, et al.
Aantal pagina's: 1 - Mitotic dysregulation at tumor initiation creates a therapeutic vulnerability to combination anti-mitotic and pro-apoptotic agents for MYCN-driven neuroblastoma(2023)
Auteurs: Lei Zhai, Anushree Balachandran, Rebecca Larkin, Janith A. Seneviratne, Sylvia A. Chung, Amit Lalwani, Shoma Tsubota, Dominik Beck, Kenji Kadomatsu, Anneleen Beckers, et al.
- Dramatic impact of blood collection tube and RNA purification method on extracellular RNA transcriptomes(2023)
Auteurs: Jasper Anckaert, Francisco Avila Cobos, Anneleen Decock, Philippe Decruyenaere, Jill Deleu, Katleen De Preter, Olivier De Wever, Jilke De Wilde, Bert Dhondt, Thibaut D'huyvetter, et al.
Aantal pagina's: 1 - Circulating immune cell dynamics as outcome predictors for immunotherapy in non-small cell lung cancer(2023)
Auteurs: Alvaro Marcos Rubio, Celine Everaert, Eufra Van Damme, Katleen De Preter, Karim Vermaelen
- Memory of stochastic single-cell apoptotic signaling promotes chemoresistance in neuroblastoma(2023)
Auteurs: Jordan F. Hastings, Sharissa L. Latham, Alvin Kamili, Madeleine S. Wheatley, Jeremy Z. R. Han, Marie Wong-Erasmus, Monica Phimmachanh, Max Nobis, Chiara Pantarelli, Antonia L. Cadell, et al.