< Terug naar vorige pagina
Onderzoeker
Jo Vandesompele
- Trefwoorden:DNA, Niet-coderend RNA, vloeibare biopsie, kanker, RNA, Toegepaste bio-informatica, DNA en RNA sequenering, digitale PCR
- Disciplines:Klinische genetica en moleculaire diagnostiek, Single-cell data analyse, Kankerdiagnose, Kankerbiologie, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Kankertherapie, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Medische genomics, Medische epigenomics
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 1997 → 30 sep 2018
Projecten
31 - 40 of 77
- Centrum voor Bioassay Ontwikkeling en Screening (C-BIOS)Vanaf1 feb 2017 → 30 nov 2022Financiering: BOF - Nieuwe Onderzoeksinitiatieven
- Exosomen in patiënten met prostaatkanker: waar komen ze vandaan en waar gaan ze heen?Vanaf1 okt 2016 → 29 feb 2020Financiering: FWO mandaten
- Therapeutische toepassing van SAMMSON lncRNA remming bij oculaire melanomen en niet-melanome tumorenVanaf15 jul 2016 → 31 dec 2019Financiering: IOF - Industrieel Onderzoeksfonds
- onderzoeksopdracht Hetty HelsmoortelVanaf1 jul 2016 → 30 sep 2016Financiering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- miRNA - ChemoresistanceVanaf15 apr 2016 → 30 sep 2018Financiering: IOF - Industrieel Onderzoeksfonds
- Identificatie en functionale karakterisatie van niet-coderende RNAs in kankerVanaf1 jan 2016 → 31 dec 2019Financiering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Lange niet-coderende RNAs in kanker: ontrafelen van de donkere materie van het kankergenoomVanaf1 jan 2016 → 31 dec 2022Financiering: BOF - Geconcert. Onderzoeksacties vanaf 1994
- Exploratie van het neuroblastoom-DNA-methyloom: identificatie van verschillen tussen biologische subgroepen en optimalisatie van biomerkerdetectie in plasma.Vanaf1 okt 2015 → 30 sep 2016Financiering: FWO Humanitair onderzoeksproject Kom op tegen kanker
- Validatie van kandidaat TP53-lncRNA’s door middel van een hogedoorvoer shRNA screeningVanaf1 jan 2015 → 31 dec 2017Financiering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Decoderen lange niet-coderende RNA's in kanker - Stichting tegen kankerVanaf1 jan 2015 → 31 dec 2018Financiering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
Publicaties
1 - 10 van 433
- Human skeletal muscle fiber heterogeneity beyond myosin heavy chains(2025)Gepubliceerd in: NATURE COMMUNICATIONSISSN: 2041-1723Issue: 1Volume: 16
- Blood collection tube and RNA purification method recommendations for extracellular RNA transcriptome profiling(2025)Gepubliceerd in: NATURE COMMUNICATIONSISSN: 2041-1723Issue: 1Volume: 16
- Digital PCR-based gene expression analysis using a highly multiplexed assay with universal detection probes to study induced pluripotent stem cell differentiation into cranial neural crest cells(2025)Series: Methods in molecular biology (MIMB)Pagina's: 17 - 47
- Cellular deconstruction of the human skeletal muscle microenvironment identifies an exercise-induced histaminergic crosstalk(2025)Gepubliceerd in: CELL METABOLISMISSN: 1932-7420Issue: 4Volume: 37Pagina's: 842 - 856.e7
- Characterizing the cell-free transcriptome in a humanized diffuse large B-cell lymphoma patient-derived tumor xenograft model for RNA-based liquid biopsy in a preclinical setting(2024)Gepubliceerd in: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCESISSN: 1422-0067Issue: 18Volume: 25
- Transcriptomic signatures of human single skeletal muscle fibers in response to high-intensity interval exercise(2024)Gepubliceerd in: AMERICAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY-CELL PHYSIOLOGYISSN: 1522-1563Issue: 5Volume: 327Pagina's: C1249 - C1262
- Nationwide quality assurance of high-throughput diagnostic molecular testing during the SARS-CoV-2 pandemic : role of the Belgian National Reference Centre(2024)Gepubliceerd in: VIROLOGY JOURNALISSN: 1743-422XIssue: 1Volume: 21
- Identification and validation of extracellular vesicle reference genes for the normalization of RT‐qPCR data(2024)Gepubliceerd in: JOURNAL OF EXTRACELLULAR VESICLESISSN: 2001-3078Issue: 4Volume: 13
- Nucleic acid degradation as barrier to gene delivery : a guide to understand and overcome nuclease activity(2024)Gepubliceerd in: CHEMICAL SOCIETY REVIEWSISSN: 1460-4744Issue: 1Volume: 53Pagina's: 317 - 360
- HTSplotter : an end-to-end data processing, analysis and visualisation tool for chemical and genetic in vitro perturbation screening(2024)Gepubliceerd in: PLOS ONEISSN: 1932-6203Issue: 1Volume: 19
Patenten
1 - 10 van 10
- Method to screen, diagnose or monitor treatment using increased numbers of deviating analytes
- Usages of recombinant extracellular vesicles
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma
- Usages of recombinant extracellular vesicles
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma
- Usages of recombinant extracellular vesicles
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma
- NEUROBLASTOMA PROGNOSTIC MULTIGENE EXPRESSION SIGNATURE
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma