Onderzoeker
Stein Aerts
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Adaptive agents en intelligente robotica
- Disciplines (KU Leuven):Andere biologische wetenschappen
- Zie ook: Stein Aerts (Vlaams Instituut voor Biotechnologie)
Affiliaties
- Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Verantwoordelijke
Vanaf1 okt 2009 → Heden - VIB Center for AI & Computational Biology (Onderzoekscentrum)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → Heden - C20 Support (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → 31 dec 2023 - Dynamische Systemen, Signaalverwerking en Gegevensanalyse (STADIUS) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 aug 2020 → 30 sep 2004 - Aerts Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 okt 2009 → Heden - Departement Menselijke Erfelijkheid (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2005 → 30 nov 2017
Projecten
1 - 10 of 66
- Genregulatie begrijpen in een heel dier: Van het bouwen van een regulatie-atlas tot het decoderen van genregulatie met deep learningVanaf10 jan 2024 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SpaceTimeOmics: combinatie van hogedoorvoer spatial omics met AI om generegulatie te modeleren in een organisme doorheen de tijdVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Interpretatie van genomische regulatorische variatie in de menselijke hersenen en de ziekte van Parkinson, door integratie van deep learning en single-cell multi-omicsVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Deep learning gebaseerd synthetisch ontwerp en massaal parallelle reporterassays om celtype- specifieke enhancer te karakteriseren en te benuttenVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Enhancer-AI: AI-gestuurde modellering en ontwerp van celtype-specifieke versterkers voor gentherapieVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategisch Basisonderzoek (SBO)
- Deep learning oplossingen voor het ontcijferen van genregulatie in het menselijk breinVanaf7 mrt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Toepassingen van deep learning voor kankergenomicaVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Evolutie van de genomische regulatorische code die ten grondslag ligt aan neuronale diversiteitVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SymBioSys: Analyse van de genomische heterogeneïteit via de computationele analyse van lange DNA fragmentenVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Ontrafelen van genregulatie Drosophila melanogaster: naar een regulatiemap in één-cel resolutieVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
Publicaties
91 - 100 van 123
- Mismatch repair deficiency endows tumors with a unique mutation signature and sensitivity to DNA double-strand breaks(2014)
Auteurs: Hui Zhao, Bernard Thienpont, Matthieu Moisse, Xavier Sagaert, Stefanie Schrauwen, Dominiek Smeets, Gert Matthijs, Stein Aerts, Jan Cools, Frédéric Amant, et al.
- iRegulon: From a Gene List to a Gene Regulatory Network Using Large Motif and Track Collections(2014)
Auteurs: Annelien Verfaillie, Hana Imrichova, Bram Van de Sande, Laura Standaert, Marina Naval Sanchez, Delphine Potier, Dmitry Svetlichnyy, Zeynep Kalender Atak, Mark Fiers, Chris Marine, et al.
- Identification of cis-regulatory modules encoding temporal dynamics during development(2014)
Auteurs: Delphine Potier, Stein Aerts
Pagina's: 534 - Male-Specific Fruitless Isoforms Target Neurodevelopmental Genes to Specify a Sexually Dimorphic Nervous System(2014)
Auteurs: Bram Van de Sande, Stein Aerts
Pagina's: 229 - 241 - Comprehensive analysis of transcriptome variation uncovers known and novel driver events in T-cell acute lymphoblastic leukemia(2013)
Auteurs: Zeynep Kalender Atak, Kim De Keersmaecker, Ellen Geerdens, Anne Uyttebroeck, Peter Vandenberghe, Jan Cools, Stein Aerts
- Alteration of the microRNA network during the progression of Alzheimer's disease(2013)
Auteurs: Pierre Lau Poui Cheung, Evgenia Salta, Annerieke Sierksma, Amantha Thathiah, Smaragda Papadopoulou, Stein Aerts, Bart De Strooper
Pagina's: 1613 - 34 - Genome-wide analyses of Shavenbaby target genes reveals distinct features of enhancer organization(2013)
Auteurs: Stein Aerts
- Genome-wide analyses of Shavenbaby target genes reveals distinct features of enhancer organization(2013)
Auteurs: Delphine Menoret, Marc Santolini, Isabelle Fernandes, Rebecca Spokony, Jennifer Zanet, Ignacio Gonzalez, Yvan Latapie, Pierre Ferrer, Herve Rouault, Kevin P White, et al.
- Six minute walk test in type III spinal muscular atrophy: a 12month longitudinal study(2013)
Auteurs: Marleen Van den Hauwe, Stein Aerts, Nathalie Goemans
Pagina's: 624 - 628 - Cancer: Mutations close in on gene regulation(2013)
Auteurs: Stein Aerts, Jan Cools
Pagina's: 35 - 6