< Terug naar vorige pagina
Onderzoeker
Jo Vandesompele
- Trefwoorden:DNA, Niet-coderend RNA, vloeibare biopsie, kanker, RNA, Toegepaste bio-informatica, DNA en RNA sequenering, digitale PCR
- Disciplines:Klinische genetica en moleculaire diagnostiek, Single-cell data analyse, Kankerdiagnose, Kankerbiologie, Bio-informatica van ziekten, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Ontwikkeling van bio-informatica software, tools en databases, Kankertherapie, Bio-informatica en computationele biologie niet elders geclassificeerd, Medische genomics, Medische epigenomics
Affiliaties
- Vakgroep Biomoleculaire Geneeskunde (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2018 → Heden - Vakgroep Pediatrie en genetica (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 1997 → 30 sep 2018
Projecten
1 - 10 of 77
- Multiplex digitale PCR voor toepassingen met grote impact binnen diverse onderzoeksgroepen in de biowetenschappenVanaf1 dec 2025 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Robuuste, duurzame en semi-geautomatiseerde aanmaak van sequencingbibliotheken via Mantis-dosering en PuriFY-opzuiveringVanaf1 dec 2025 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Implementatie van celvrije RNA-signaturen voor minimale invasieve fenotypering, risicostratificatie en opvolging van patiënten met diffuus grootcellig B-cellymfoomVanaf1 feb 2025 → HedenFinanciering: VZW en equivalenten
- Cofinanciering kernfaciliteit - De digitale PCR CoreVanaf1 feb 2025 → HedenFinanciering: BOF - onderzoeksorganisaties
- Studie van de cellulaire heterogeniteit veroorzaakt door gerichte therapieën in neuroblastoom met behulp van ruimtelijke transcriptoomanalyse en vloeibare bioptenVanaf1 jan 2025 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Het ruimtelijk in kaart brengen van mutante klonen om de rol van interklonale competitie in menselijke tumorvorming te begrijpen.Vanaf1 jan 2025 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Onderzoek naar verworven resistentie en herval via multi-omics ruimtelijke analyse van neuroblastoomVanaf1 jan 2025 → HedenFinanciering: Stichtingen, fondsen e.d. met wetenschappelijk oogmerk
- In kaart brengen van de cellulaire heterogeniteit veroorzaakt door gerichte therapieën in neuroblastoom met behulp van ruimtelijke transcriptoom analyse en vloeibare biopsieënVanaf25 nov 2024 → HedenFinanciering: VZW en equivalenten
- Xenotransplantatie in ratten voor de analyse van tumoraal extracellulair RNA in vloeibare bioptenVanaf1 nov 2024 → HedenFinanciering: FWO senior postdoctoraal mandaat
- Fotolitografische DNA printer voor massaal parallelle synthese van DNA oligonucleotiden voor ruimtelijke -omics en hybrid capture target enrichment toepassingenVanaf1 mei 2024 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
Publicaties
41 - 50 van 336
- Substantial performance differences among RNA purification kits and blood collection tubes in the Extracellular RNA Quality Control (exRNAQC) study(2021)Aantal pagina's: 1
- Messenger RNA capture sequencing of extracellular RNA from human biofluids using a comprehensive set of spike-in controls(2021)Gepubliceerd in: STAR PROTOCOLSISSN: 2666-1667Issue: 2Volume: 2
- Targeted therapy of TERT-rearranged neuroblastoma with BET bromodomain inhibitor and proteasome inhibitor combination therapy(2021)Gepubliceerd in: CLINICAL CANCER RESEARCHISSN: 1557-3265Issue: 5Volume: 27Pagina's: 1438 - 1451
- Circulating RNA biomarkers in diffuse large B-cell lymphoma : a systematic review(2021)Gepubliceerd in: EXPERIMENTAL HEMATOLOGY & ONCOLOGYISSN: 2162-3619Issue: 1Volume: 10
- The RNA Atlas expands the catalog of human non-coding RNAs (June, 10.1038/s41587-021-00936-1, 2021)(2021)Gepubliceerd in: NATURE BIOTECHNOLOGYISSN: 1546-1696Issue: 11Volume: 39Pagina's: 1467 - 1467
- Recurrent chromosomal imbalances provide selective advantage to human embryonic stem cells under enhanced replicative stress conditions(2021)Gepubliceerd in: GENES CHROMOSOMES & CANCERISSN: 1098-2264Issue: 4Volume: 60Pagina's: 272 - 281
- Genome-wide study of the effect of blood collection tubes on the cell-free DNA methylome(2021)Gepubliceerd in: EPIGENETICSISSN: 1559-2308Issue: 7Volume: 16Pagina's: 797 - 807
- The MicroRNA landscape of acute beta cell destruction in type 1 diabetic recipients of intraportal islet grafts(2021)Gepubliceerd in: CELLSISSN: 2073-4409Issue: 7Volume: 10
- SPsimSeq : semi-parametric simulation of bulk and single-cell RNA-sequencing data(2020)Gepubliceerd in: BIOINFORMATICSISSN: 1460-2059Issue: 10Volume: 36Pagina's: 3276 - 3278
- Charting extracellular transcriptomes in the human biofluid RNA atlas(2020)Gepubliceerd in: CELL REPORTSISSN: 2211-1247Issue: 13Volume: 33
Patenten
1 - 10 van 10
- Method to screen, diagnose or monitor treatment using increased numbers of deviating analytes
- Usages of recombinant extracellular vesicles
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma
- Usages of recombinant extracellular vesicles
- Biomarkers for disease burden of neuroblastoma
- Usages of recombinant extracellular vesicles
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma
- NEUROBLASTOMA PROGNOSTIC MULTIGENE EXPRESSION SIGNATURE
- Inhibition of a lncRNA for treatment of melanoma
Gelinkte datasets
1 - 7 van 7
- Characterizing the cell-free transcriptome in a humanized DLBCL patient-derived tumor xenograft model for RNA-based liquid biopsy in a preclinical setting
- Benchmarking blood collection tubes and processing intervals for extracellular vesicle performance metrics
- Blood plasma and FFPE derived total RNA seq dataset from DLBCL and PMBCL patients
- Whole transcriptome profiling of liquid biopsies from tumour xenografted mouse models enables specific monitoring of tumour-derived extracellular RNA
- mRNA Capture Sequencing and RT-qPCR for the Detection of Pathognomonic, Novel, and Secondary Fusion Transcripts in FFPE Tissue: A Sarcoma Showcase
- Exploration of neuroblastoma xenograft models for tumor extracellular RNA profiling in murine blood plasma
- Messenger RNA capture sequencing of extracellular RNA from human biofluids using a comprehensive set of spike-in controls