Onderzoeker
Stein Aerts
- Disciplines (Flanders Institute for Biotechnology):Adaptive agents en intelligente robotica
- Disciplines (KU Leuven):Andere biologische wetenschappen
- Zie ook: Stein Aerts (Vlaams Instituut voor Biotechnologie)
Affiliaties
- Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Verantwoordelijke
Vanaf1 okt 2009 → Heden - VIB Center for AI & Computational Biology (Onderzoekscentrum)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → Heden - C20 Support (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jul 2023 → 31 dec 2023 - Dynamische Systemen, Signaalverwerking en Gegevensanalyse (STADIUS) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 aug 2020 → 30 sep 2004 - Aerts Lab (Onderzoeksgroep)
Verantwoordelijke
Vanaf1 jan 2017 → Heden - Laboratorium voor Computationele Biologie (VIB-KU Leuven) (Afdeling)
Lid
Vanaf1 okt 2009 → Heden - Departement Menselijke Erfelijkheid (Departement)
Lid
Vanaf1 okt 2005 → 30 nov 2017
Projecten
1 - 10 of 66
- Genregulatie begrijpen in een heel dier: Van het bouwen van een regulatie-atlas tot het decoderen van genregulatie met deep learningVanaf10 jan 2024 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SpaceTimeOmics: combinatie van hogedoorvoer spatial omics met AI om generegulatie te modeleren in een organisme doorheen de tijdVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: FWO Onderzoeksproject (incl. WEAVE projecten)
- Interpretatie van genomische regulatorische variatie in de menselijke hersenen en de ziekte van Parkinson, door integratie van deep learning en single-cell multi-omicsVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO junior postdoctoraal mandaat
- Deep learning gebaseerd synthetisch ontwerp en massaal parallelle reporterassays om celtype- specifieke enhancer te karakteriseren en te benuttenVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Enhancer-AI: AI-gestuurde modellering en ontwerp van celtype-specifieke versterkers voor gentherapieVanaf1 okt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategisch Basisonderzoek (SBO)
- Deep learning oplossingen voor het ontcijferen van genregulatie in het menselijk breinVanaf7 mrt 2023 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Toepassingen van deep learning voor kankergenomicaVanaf1 jan 2023 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- Evolutie van de genomische regulatorische code die ten grondslag ligt aan neuronale diversiteitVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
- SymBioSys: Analyse van de genomische heterogeneïteit via de computationele analyse van lange DNA fragmentenVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: BOF - projecten
- Ontrafelen van genregulatie Drosophila melanogaster: naar een regulatiemap in één-cel resolutieVanaf1 okt 2022 → HedenFinanciering: Eigen Middelen zoals patrimonium, inschrijvingsgelden, giften, ....
Publicaties
31 - 40 van 123
- Unravelling enhancer landscapes in melanoma(2020)
Auteurs: Liesbeth Minnoye, Stein Aerts, Jasper Wouters, Chris Marine
- LifeTime and improving European healthcare through cell-based interceptive medicine(2020)
Auteurs: Stein Aerts, Bart De Strooper, Chris Marine, Thierry Voet
Pagina's: 377 - 386 - Drosophila Voltage-Gated Sodium Channels Are Only Expressed in Active Neurons and Are Localized to Distal Axonal Initial Segment-like Domains(2020)
Auteurs: Jasper Janssens, Stein Aerts
Pagina's: 7999 - 8024 - Robust gene expression programs underlie recurrent cell states and phenotype switching in melanoma(2020)
Auteurs: Jasper Wouters, Liesbeth Minnoye, Katina Spanier, David Mauduit, Kristofer Davie, Michael Dewaele, Dennis Pedri, Frederik Ceyssens, Chris Marine, Stein Aerts
Pagina's: 986 - + - A scalable SCENIC workflow for single-cell gene regulatory network analysis(2020)
Auteurs: Kristofer Davie, Sara Aibar Santos, Stein Aerts
Pagina's: 2247 - 2276 - Genomic adaptations to aquatic and aerial life in mayflies and the origin of insect wings(2020)
Auteurs: Kristofer Davie, Stein Aerts
- Identification of genomic enhancers through spatial integration of single-cell transcriptomics and epigenomics(2020)
Auteurs: Ibrahim Ihsan Taskiran, Kristofer Davie, Valerie Christiaens, David Mauduit, Stein Aerts
- Peritumoral activation of the Hippo pathway effectors YAP and TAZ suppresses liver cancer in mice(2019)
Auteurs: Ivan Moya, Stephanie Castaldo, Soheil Soheily, Jun Xie, Elisabeth Verboven, Hanne Hillen, Ruçhan Karaman, Matthias Van Haele, Weronika Kowalczyk, Panagiotis Karras, et al.
Pagina's: 1029 - 1034 - Cortical Neurogenesis Requires Bcl6-Mediated Transcriptional Repression of Multiple Self-Renewal-Promoting Extrinsic Pathways(2019)
Auteurs: Stein Aerts, Pierre Vanderhaeghen
Pagina's: 1096 - + - GRNBoost2 and Arboreto: efficient and scalable inference of gene regulatory networks(2019)
Auteurs: Thomas Moerman, Sara Aibar Santos, Carmen Bravo González-Blas, Jaak Simm, Yves Moreau, Jan Aerts, Stein Aerts
Pagina's: 1 - 3