Onderzoeker
Filip Van Nieuwerburgh
- Trefwoorden:Massively parallel sequencing, Toegepaste bio-informatica
- Disciplines:Farmogenetica en -genomica, Genetica, Epigenetica, Immunogenetica
Affiliaties
- Vakgroep Geneesmiddelenleer (Departement)
Lid
Vanaf1 sep 1999 → Heden
Infrastructuur
1 - 1 van 1
- PromethION: nanopore sequencer met hoge doorvoer voor DNA en RNA sequenering met lange leeslengte. (Consortium coordinator)
Projecten
1 - 10 of 26
- Ontrafelen van de rol van het immuunsysteem bij de ontwikkeling van hypergranulatieweefsel in wonden bij paardenVanaf1 jan 2024 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- Extracellulaire vesikels uit het follikelvocht zijn sleutelfactoren voor een betere ontwikkeling van verse en gevitrificeerde eicellen bij het paardVanaf16 okt 2023 → HedenFinanciering: BOF - postdoctorale mandaten
- qPCR systeem voor kwaliteitscontrole van NGS staalvoorbereiding, meting van genexpressie, hybridisatiecurve, en smeltcurve analyseVanaf15 dec 2022 → HedenFinanciering: BOF - wetenschappelijk apparatuurprogramma
- Cofinanciering kernfaciliteit - Gent Licht Microscopie (GLiM)Vanaf1 jul 2022 → HedenFinanciering: BOF - onderzoeksorganisaties
- Cofinanciering core facility - UGent NGS CoreVanaf1 jul 2022 → HedenFinanciering: BOF - onderzoeksorganisaties
- Modulaire high-end massaspectrometer voor ultragevoelige kwantificatie en beeldvorming van kleine organische moleculen in cross-health onderzoek - MSsmall-XHVanaf1 mei 2022 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
- Empirische exploratie van nieuwe DNA probes voor hybridisatie met tandem repeatsVanaf1 nov 2021 → HedenFinanciering: FWO Strategische Onderzoeksbeurs
- Nanopore-sequencing van complete farmacogenen na CRISPR/Cas9-verrijking bij tamoxifen- en clopidogrel-patiënten, waardoor verbeterde haplotypering en voorspelling van de werkzaamheid met machine learning mogelijk is.Vanaf1 okt 2021 → HedenFinanciering: BOF - doctorale mandaten
- PEA histon modificatie proteomicsVanaf1 mrt 2021 → 31 dec 2023Financiering: IOF - technologie validatie in labo
- Stimulated emission depletion microscopy (STED): Nanoscopie voor innovatief onderzoek in de levenswetenschappenVanaf1 mei 2020 → HedenFinanciering: FWO Middelzware apparatuur
Publicaties
31 - 40 van 274
- Veterinarians’ competence in applying basic genetic principles and daily implementation of clinical genetics : a study in a university environment(2022)
Auteurs: Evelien Bogaerts, Else den Boer, Luc Peelman, Filip Van Nieuwerburgh, Hille Fieten, Jimmy Saunders, Bart Broeckx
Pagina's: 799 - 806 - Signatures of polygenic adaptation align with genome-wide methylation patterns in wild strawberry plants(2022)
Auteurs: Hanne De Kort, Tuomas Toivainen, Filip Van Nieuwerburgh, Javier Andres, Timo P. Hytonen, Olivier Honnay
Pagina's: 1501 - 1514 - Nanopore sequencing of a forensic combined STR and SNP multiplex(2022)
Auteurs: Olivier Tytgat, Sonja Skevin, Dieter Deforce, Filip Van Nieuwerburgh
- PIWI proteins play an antiviral role in Lepidopteran cell lines(2022)
Auteurs: Dulce Santos, Thomas-Wolf Verdonckt, Lina Mingels, Stijn Van den Brande, Bart Geens, Filip Van Nieuwerburgh, Anna Kolliopoulou, Luc Swevers, Niels Wynant, Jozef Vanden Broeck
- Metallothioneins alter macrophage phenotype and represent novel therapeutic targets for acetaminophen-induced liver injury(2022)
Auteurs: Sanne Van Campenhout, Sander Lefere, Sarah Raevens, Laurentijn Tilleman, Filip Van Nieuwerburgh, Hannelore P. Van Eeckhoutte, Anne Hoorens, Michael A. Lynes, Anja Geerts, Debby Laukens
Pagina's: 123 - 133 - Lycopene supplementation to serum-free maturation medium improves in vitro bovine embryo development and quality and modulates embryonic transcriptomic profile(2022)
Auteurs: Shehu Sidi, Osvaldo Américo Bogado Pascottini, Daniel Angel Velez, Nima Azaridolatabad, Krishna Pavani, . Gretania Residiwati, Tim Meese, Filip Van Nieuwerburgh, Elias Kambai Bawa, Ambrose Alikidon Voh, et al.
- RRM2 enhances MYCN-driven neuroblastoma formation and acts as a synergistic target with CHK1 inhibition(2022)
Auteurs: Carolina de Carvalho Nunes, Lisa Depestel, Liselot Mus, Kaylee M. Keller, Louis Delhaye, Amber Louwagie, Muhammad Rishfi, Alex Whale, Neesha Kara, Simon R. Andrews, et al.
- Metabolism and health effects of rare sugars in a CACO-2/HepG2 coculture model(2022)
Auteurs: Amar Daniël Emanuel Van Laar, Charlotte Grootaert, Filip Van Nieuwerburgh, Dieter Deforce, Tom Desmet, Koen Beerens, John Van Camp
- A tapt1 knockout zebrafish line with aberrant lens development and impaired vision models human pediatric cataract(2022)
Auteurs: Tamara Jarayseh, Brecht Guillemyn, Hanna De Saffel, Jan Willem Bek, Sujatha Jagadeesh, Sofie Symoens, Fransiska Malfait, Delfien Syx, Filip Van Nieuwerburgh, Yannick Gansemans, et al.
Aantal pagina's: 1 - Multigenerational DNA methylation responses to copper exposure in daphnia : potential targets for epigenetic biomarkers?(2022)
Auteurs: Guilherme Jeremias, Telma Veloso, Fernando J.M. Gonçalves, Filip Van Nieuwerburgh, Joana Luísa Pereira, Jana Asselman
Patenten
1 - 2 van 2
- Hydrolysis-based probe and method for STR genotyping (Inventor)
- Probe and method for STR-genotyping (Inventor)